色譜柱由柱管、壓帽、卡套(密封環)、篩板(濾片)、接頭、螺絲等組成。柱管多用不銹鋼制成，壓力不高于70kg/cm2時，也可采用厚壁玻璃或石英管，管內壁要求有很高的光潔度。為提高柱效，減小管壁效應，不銹鋼柱內壁多經過拋光。也有人在不銹鋼柱內壁涂敷氟塑料以提高內壁的光潔度，其效果與拋光相同。還有使用熔融硅或玻璃襯里的，用于細管柱。色譜柱兩端的柱接頭內裝有篩板，是燒結不銹鋼或鈦合金，孔徑0.2~20µm(5~10µm)，取決于填料粒度，目的是防止填料漏出。
色譜柱的安裝：
⑴、用過濾和脫氣的流動相(不含緩沖鹽)*沖洗色譜儀的泵和管路，務必使系統中不含氣泡。
⑵、根據色譜柱上所標示的流動相流向，將色譜柱入口與泵端管路相連，柱出口不連。
⑶、將泵的流速設為0.1mL/min或更低，流速緩慢地上升到正常流速(t>5min)。⑷、當溶劑從色譜柱出口端自由流出時，將流速設為0，把柱出口與檢測器端的管路相連。
⑸、用10-30倍柱體積的流動相、正常流速平衡色譜柱。
⑹、氨基柱、氰基柱既可在正相環境下使用，也可在反相環境下工作。當需要從反相變為正相或正相變為反相時，需要用20-30倍柱體積的THF作為過渡溶劑沖洗系統，否則易使泵的單向閥堵塞，出現壓力異常的現象。
